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纽约高科技教师获得$ 470K的研究经费

2020年10月1日

图为:冠状病毒单链RNA

技术教师的纽约理工学院从卫生研究院(NIH)和美国国家科学基金会(NSF)的国家机构接受了$ 470,000的研究经费。

盛隆Zhang博士,副教授 生物及化学科学艺术和科学学院bt365体育在线 和主要研究者,并 温家李博士,副教授 计算机科学工程与计算机科学学院bt365体育在线 和合作者在研究中,来自美国国立卫生研究院接受了$ 350,000个 - 国家人类基因组研究所在RNA测序解开谜团。 索菲亚domokos博士,助理教授 物理 在艺术和科学学院bt365体育在线,在粒子物理学收到来自美国国家科学基金会$ 120,000到预先研究。仔细阅读,了解他们的学习。

LC(液相色谱)/ MS(质谱法)为基础的直接RNA测序伴随能力在单碱基分辨率序列的多个碱基修饰

RNA的核苷酸修饰已被链接到主要的疾病,如乳腺癌,2型糖尿病和肥胖。超过40次RNA核苷酸修改最近在SARS-COV-2,病毒引起covid-19发现。由于缺乏能够未知序列RNA修饰方法,他们的身份和功能仍是一个谜。盛隆张的为期一年的研究旨在揭示任何类型的RNA不同修改的身份和位置,包括SARS病毒 - 2 RNA未知的修改一样,都在一项研究中。

尽管170多个RNA核苷酸修改,迄今已发现,很少有人进行了详细审查,因为目前可用的方法是有限的。典型地,这些RNA作图方法仅专为单一类型的已知的核苷酸修饰的,并且可以不表示任何未知或其它类型的,即使他们的核苷酸修饰的共存于同一RNA分子英寸这些RNA修饰是由目前的高通量测序技术,它不直接序列的RNA本身不可检测的,但序列它们的cDNA(即从RNA的合成与模板互补的DNA),其仅包含在DNA分子中发现的4个正则脱氧核苷酸,腺嘌呤(A),胞嘧啶(C),鸟嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T)。

张新的测序技术将允许对以前未知的和不同的修改在一个RNA分子的发现以及对起因和最终的治疗方法与这些核苷酸修饰疾病支持研究。

以前的研究已经表明,质谱(MS)为基础的测序是不使用cDNA以直接测序的RNA是可行的。 “我们现在可以与任何类型的他们的RNA序列专注于我们的技术的进一步发展作为通用平台序列的任何核苷酸修饰,在一起,一劳永逸地在一个单独的研究,”张说。 “这些信息可能是在理解SARS冠状病毒-2感染周期的关键,且有可能提供线索理解如何SARS-COV-2使人生病,以及在当前的流行或未来可能再出现开发有效的治疗。”

本研究中,与哥伦比亚大学和cerno生物科学合作进行的,是之前由张的R21基金的支持张某的直接RNA测序的发展不断研究的延续。在2017年,他和李 接受了$ 568,000津贴 来自美国国立卫生研究院的国家人类基因组研究所合作开发,可以用来分析人类,动物RNA修饰RNA测序方法,和细菌细胞。

芮成钢:孤子全息

索菲亚domokos为期三年的研究将调查此事的内部运作。已经有了解此事,以及他们如何做人的基本构建块了长足的进步,但仍存在悬而未决的问题。 “这些系统中的基本粒子相互作用如此有力,常常,我们根本无法跟踪他们,说:” domokos。 “有时一个新的订单出现,电子组队,让电流流过下去;基本粒子称为夸克和胶子聚集在一起,形成在原子核的质子和中子。基本粒子如何精确地产生新秩序仍是一个谜。”

domokos将使用全息对偶,从弦论的一个概念,使像在细胞核内的颗粒和用来描述它们的数学基础物理系统的了解进展情况。她的研究将侧重于现实世界的强耦合像在原子核的质子和中子,这可以在数学上描述为孤子粒子(孤波动作状粒子)在全息两重性。她将研究在特殊的弦理论体系称为d-brane的路口,其中有强大的孤子调查机器内置的这些对象。 

“弦理论中,有很多,你可以创建一个使用全息二元不同的宇宙,”她解释说。 “我们的目标始终是创造粒子的行为的准确描述,所以我们想使弦理论模型尽可能接近什么,我们在现实世界中看到的。但争取在我们准确的模型,尤其是在全息背景下二重性,可以得到如下的足够复杂到几乎顽固性框架,使我们诉诸近似值,以便取得进展,可能在更深的结构示意粉饰“。

domokos决定把从一开始就大近似,使用附带了许多强大的数学工具,一个简单的框架,希望这会让她搜集可以反射至少近似,在现实世界中的下层图案。 “想象一下在树上的树皮条纹的图案。我们都可以看到,在树皮而隆起形成一个大致规律,但不完美的规则,”她解释说。 “不过,你也许可以学到很多关于树的工作原理为生物系统和通过使树有脊是完全平行的,并以均匀的间隔隔开的一个模型,可以如何与它的环境。这就是那种近似我试图使在核颗粒的。”

domokos将与本科生工作,以及 凯文公园,m.f.a.,数字艺术设计,谁将会使用VR创建弦理论的可视化的助理教授。